Второй сезон рассказывает о периоде после трагедии у научного института. Люди сгорают во время странного обряда и расследование поручают Владимиру Чубину. Его напарником снова становится Егор Фёдоров. Почти сразу появляются сведения о похожем случае на Невском проспекте, а найденная повесть указывает на культ огня. След приводит к группе, чьи ритуалы повторяют текст, становится ясно, что жертвы подбираются заранее.
Паралельно в 1941 году, в карельской деревне распространяются слухи об обрядах, и молодой Ивашка пытается остановить происходящее. В Ленинграде Чубин сталкивается с прошлым, связанным с сектой, а исчезновение Паши усиливает риск. Найденные тайные комнаты и письма раскрывают структуру культа. Попытка задержания оборачивается гибелью свидетеля. Когда становится известно о подготовке обряда в ночь полнолуния, Чубин и Фёдоров выходят на след.